Scénario 10 Trouver des séquences de mammouth dans les banques de données

NEWT Banque de données donnant des informations sur la classification des organismes

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Objectif : être capable de trouver une séquence d'un organisme éteint

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Pour cela il est plus simple d'utiliser la banque de donnée de taxonomie NEWT

Solution

Tapez en anglais : mammoth

Swiss-Prot Banque de données de séquences de protéines annotées manuellement et regroupant un maximum d'information biologiques et de liens vers les autres banques de données.

Une fois trouvée l'espèce, vous avez des liens vers les séquences de protéines se trouvant soit dans Swiss-Prot, soit dans TrEMBL.

Pour Swiss-Prot vous avez par exemple le Cytochrome C Solution

Autres possibilités

• Vous pouvez essayer de trouver une séquence de Dodo (solution) et par la même occasion, son vrai nom. ou des séquences du "jumping cucumber" solution
• Il y aussi la plus grande grande fleur du monde : Amorphophallus titanum solution

Remarque: beaucoup de séquences des espèces exotiques sont des cytochromes, car ces protéines sont beaucoup utilisées pour les études évolutives (phylogénétiques).

C'est une protéine de l'ADN mitochondrial, transmission maternelle).

Dernière révision novembre 2009. Au rythme où les choses changent, il faut s'attendre à ce que certains liens ne fonctionnent plus ou que l'apparence voire la structure de certains sites aitent changé d'apparence. Le lecteur saura adapter

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Liens :

• Sélection de liens BIST