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BIST : Divers liens et ressources

Outils spécial-école Merci SwissProt

Programme simplifié pour la structure 3-D Structure browser | Documentation

Programme simplifié pour la comparaison de protéines -> arbre phylogénétique : Philophylo | Documentation

Liens vers des sites d'information sur la BIST

Une sélection des principales adresses en bioinformatique

 Swiss-Prot  http://www.uniprot.org/  Séquences de protéines
MapViewer  http://www.ncbi.nih.gov/mapview/map_search.cgi   Localisation des gènes sur les chromosomes 
Entrez http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/index.html Carte de tous les portails qu'offre le NIH
EntrezGene http://www.ncbi.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene  Infos génomiques toutes espèces 
Entrez protein: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Protein Moteur de recherche orienté protéines
Entrez nucleotide: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?CMD=search&DB=nucleotide Moteur de recherche orienté nucléotides
RefSeq http://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/ Séquences ADN et protéines
OMIM  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=OMIM  Infos Génétique humaine (notamment maladies)
PubMed  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=PubMed  Literature references (accède à la base Medline)
HMGD  http://archive.uwcm.ac.uk/uwcm/mg/hgmd/search.html Human Genome Mutation Database 
DOI http://www.doi.org/ Retrouver un article depuis son numéro DOI System is for identifying content objects in the digital environment.
PDB  http://www.rcsb.org/pdb/  Protein structures 
PDB Molecule of the Month http://www.rcsb.org/pdb/static.do?p=education_discussion/molecule_of_the_month/index.html Sélection de molécules avec structure 3-d de PDB
Nature Omics Gateway http://www.nature.com/omics/organisms/index.html Portail accédant aux articles sur les génomes
Nature News http://www.nature.com/news/ Nouvelles de la science @ Nature
Nature web focus Human Genomics http://www.nature.com/nature/focus/humangenome/index.html Nature ... the complete and comprehensive DNA sequence of the human genome as a freely available resource.
BLAST (NCBI)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ Recherche de similarité de séquences
Genetic Home Reference http://ghr.nlm.nih.gov/ghr/ Portail destiné au public : infos à propos des maladies génétiques
MedlinePlus http://medlineplus.gov/ brings together authoritative information. MedlinePlus also has extensive information about drugs, an illustrated medical encyclopedia, interactive patient tutorials, and latest health news.
Genes and diseases http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?call=bv.View..ShowSection&rid=gnd Maladies humaines, mutations, et infos générales.
Phylodendron http://www.es.embnet.org/Doc/phylodendron/treeprint-form.html Logiciel on-line de visionnement d'arbres = cladogrammes
ALFRED ALlele FREquency Database http://alfred.med.yale.edu/alfred/index.asp Banque de données des fréquences des allèles dans la population humaine
dbSNP http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/ Banque de données qui répertorie tous les polymorphismes humains (associés à une maladie ou non)
Genomesize http://www.genomesize.com/statistics.php La taille des génomes de nombreux organismes
Rebase http://rebase.neb.com/rebase/ Données sur les enzymes de restriction, notamment les séquences reconnues
INFOBIOGEN http://www.infobiogen.fr/services/analyseq/cgi-bin/carteres_in.pl Carte de restriction d'une séquence
Gbif http://www.gbif.org/ Global Biodiversity Information Facility (GBIF) : Offrir un libre accès aux données scientifiques primaires concernant la biodiversité
Fauna Europaea http://www.faunaeur.org/ Projet européen : rassembler tous les noms et les distributions des organismes multicellulaires. Librement accessible.
ToL http://tolweb.org/tree/ The Tree of Life Web Project (ToL) is a collaborative effort of biologists from around the world.
NEWT http://www.ebi.ac.uk/newt/ Informations taxonomiques
CSCF http://lepus.unine.ch/carto/ Centre Suisse de Cartographie de la Faune
CRSF http://www.ville-ge.ch/cjb/rsf/fra/database.htm Centre du Réseau Suisse de Floristique (CRSF)
Animal Diversity Web (ADW) http://animaldiversity.ummz.umich.edu/site/index.html (ADW) is an online database of animal natural history, distribution, classification, and conservation biology at the University of Michigan
NCBI Taxonomy browser http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/taxonomyhome.html/index.cgi The NCBI taxonomy database attempts to incorporate phylogenetic and taxonomic knowledge from a variety of sources, including the published literature, web-based databases, and the advice of sequence submitters and outside taxonomy experts.
Botanik.ch http://www.botanik.ch/ portail poour la botanique suisse (de)
Sophy http://junon.u-3mrs.fr/msc41www/ Phytotypes pour chaque plante de France
Swiss Web Flora http://www.wsl.ch/land/products/webflora/floramodul1-fr.html Cartes de distribution des espèces végétales suisses
U-Basel Botanical image database http://pages.unibas.ch/botimage/ Base de données prhotographique des plante suisses
CJB http://www.ville-ge.ch/cjb/ Jardin Botanique Genève
Index Synonymique - jardin bot Genève http://www.ville-ge.ch/cjb/rsf/fra/index/indexonl.htm Synonymes des plantes :
latin -> Fr-allemand-italien
Tela Botanica http://www.tela-botanica.org/ Le réseau de la botanique francophone
SWISS-2DPAGE http://www.expasy.org/swiss-2dpage/viewer Gels 2-d avec liens vers les protéines
Allen-Brain-Atlas http://www.brain-map.org/ Interactive, genome-wide image database of gene expression in the mouse brain

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