Complément au Scénario 5 : Un exemple, les récepteurs à phéromones

Un exemple d'usage de la Sélection de protéines, les récepteurs à phéromones

Pour le contexte : cet exemple complète la Bio-Tremplin sur les phéromones de janvier 08 :

Partir d'un des gènes de récepteur humain aux phéromones VN1R5

Effectuer un BLAST à partir du gène humain VN1R5 chez UniProt ici
Choisir VN1R5_Human (solution) et cliquer BLAST, dans la fenêtre nouvelle, cliquer une deuxième fois.
On trouve un gène chez le gorille qui est quasi-identique et de très nombreux gènes similaires chez la souris, le rat, et d'autres !

Le BLAST produit une page avec les séquences et un schéma coloré du degré de similitude et de la colinéarité.

On peut obtenir une vue d'ensemble en cliquant "Graphical overview" (cf à droite).

Cocher les cases des espèces que vous voulez comparer (seulement celles des récepteurs Phéromonaux et éviter les doublons de la même espèce).
Dans le bandeau vert en bas, cliquer le bouton Align (ou Retrieve puis cf "plus pro").
Dans le bandeau gris Sequence annotation (Features) cliquer Show pour révéler les options.
Cliquer les caractéristiques à mettre en évidence.