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Scénario 2 : d'un gel de séquence (ADN) à la protéine

Objectif : à partir d'un gel d'électrophorèse de séquençage d'un morceau de séquence d'ADN, identifier le gène, accéder aux infos le concernant.

Principe :
Un gel de séquence (gène de l'Insuline) -> séquence en acides nucléiques ->BLAST --> séquence ARN m -> nom de la prot. -> description de la prot (Medline) variante : -> séquence protéique


1° lire le gel

2° Comparer cette séquence à toutes les séquences d'ADN humain pour trouver le gène correspondant

Trouver un serveur qui offre le Blast

3° En savoir plus sur le gène.

Entrez Gene est une banque de données qui donne des informations sur les gènes humains (et d'autres espèces), leur localisation sur le génome et des informations sur leurs fonctions.

Nous savons donc que le gène est INS, que c'est l'insulin en anglais donc l'insuline.

4° En savoir encore plus sur le gène identifié

5° Trouver les séquences a.a. et nucléotides de cette protéine.

Trouver la séquence complète en acides nucléiques

Convertisseur code 1 lettre -> code 3 lettres des acides aminés : One -to-Three | Three to One
Tableau des Abbrév acides aminés à une lettre/ 3lettres


Compléments

Dernière révision novembre 2009. Au rythme où les choses changent, il faut s'attendre à ce que certains liens ne fonctionnent plus ou que l'apparence voire la structure de certains sites aitent changé d'apparence. Le lecteur saura adapter.

Liens :

 

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