Scénario 14 : Infomanagement

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Objectif : Se tenir au courant : savoir trouver les publications et les sources d'info pertinentes. Quelques exemples.

N.B: dès la fin du cours leur pertinence va baisser : c'est la démarche queces exmples illustrent qui est judicieuse.

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Utilisation de sites de vulgarisation

Le groupe Swiss-Prot a créé 2 sites de vulgarisation scientifique sur le thème des protéines : l’un en anglais Spotlight et l’autre en français Prolune .
Le site français contient des dossiers sur différentes protéines ou famille de protéines qui font ou ont fait la ‘une’ (Alzheimer, grippe aviaire, les effets de l’alcool…).
Prolune permet également d’accéder à des ‘Instantanés’ mensuels, qui racontent une anecdote autour d’une protéine

• Le dernier instantané explique comment fonctionne le Tamiflu.

• Un autre instantané raconte l’utilisation d’une protéine appelé ‘cry’ (du Bt) comme insecticide avant et après l’avènement des OGM
  

A la fin des articles vous avez accès aux entrées Swiss-Prot pour chacune des protéines. Tooouut à la fin de l’entrée, vous trouverez la séquence en acides aminés.

Exemple : Comparer les textes d'Agriculture biologique et sur les OGM et discuter des dangers.

• Le BT comme insecticide bio (@association Lyon )
• En vente dans un magasin bio
• Discussion à l'OFEFP sur les insecticides
• Les OGM dans la chaîne d'approvisionnement alimentaire (@FAO
• Les mais Bt OGM autorisés au Quebec (@gouvernement quebec)
• Tract opposant OGM et bio (@ogmdangers.org)

Un génome parmi d'autres ?

• A partir de Mapviewer
• a) Faire prendre conscience aux élèves que de nombreux génomes sont disponibles, (situation de l'humain dans le monde vivant, préalable à un arbre phyologénétique, etc)
• Interroger le nombre de génomes, les priorités de leur choix, etc
• Choisir un génome ( chimpanzee) par exemple :
• Vue des chromosomes : Observer le nombre de chromosomes
  • Dans ce cas noter le 2a 2b sous les Chromosomes et comparer a notre génome.
• Lire le petit texte : taille du génome, etc
  • choisir un chromosome P .ex 2 a : lire le nombre de gènes (723)
• Trouver un lien sur un petit portail du champanzé
• y trouver un article de nature sur les différences sur le chromosome 22 solution

c) Quel est le degré d'unicité du génome humain ?

• Analyser l'image : Original avec légende ici
• Faire construire par les élèves un graphique d'inclusion (par exemple : comme-celui-ci )
• Tenter de déterminer quels types de gènes pourraient être les plus communs à chaque catégorie, quels sont les gènes les plus fondamentaux (Duplic ADN etc -> ceux qui sont propres aux vertébrés).
• Explorer ces catégories en regardant : l'article orignal dans Nature de la publication du Draft génome humain . Notamment la figure 41 | intranet
• Comparer les génomes de 2 primates : chimpanze et humain Nature special chimpanze

Questions possibles :

• Quels sont les principaux points communs entre les Chimpanzés et nous ?
• On a souvent avancé le chiffre de 1% de différence entre le chimpanzé et nous. Qu'en sait-on maintenant ? Brève News News and views @ Nature | Intranet
• On peut aussi essayer ds questions plus ouvertes : le langage est-il le propre de l'homme... ou non ?

d) Trouver la séquence du virus de la grippe H5N1

• Depuis la page principale du NCBI
  
• Accéder à Entrez Genome
• Choisir ‘Genome’ Taper ‘H5N1’ puis cliquer sur ‘Go’ Solution
• Vous obtenez une liste de séquences (différents segments) de différentes souches du virus.
• Notez la date récente de soumission (août 2005).

  e)Un exemple de récolte de sources sur la grippe.

  Sélection de liens Grippe