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Formation Continue du 19-20 Nov. 09
PO 422 - Les nouvelles preuves de l'évolution: y accéder en classe !
TP 1 à suivre ou à adapter...
Objectifs:
Imaginer précisément comment utiliser les alignements et la construction d'arbres pour prouver l'évolution dans vos classes, avec le niveau de vos élèves et les programmes de vos cours.
Un exemple dont on peut s'inspirer :
Se référer aux indications techniques pour utiliser PhiloPhylo (http://doiop.com/phylo) ou le scénario5 selon vos préférences et les élèves que vous avez.
Autre exemple possible :
Autre exemple possible :
Faire faire d'abord un travail d'analyse des séquences pour former à la main un arbre selon l'exercice sur papier. Puis utiliser PhiloPhylo.
Préparer une insertion dans VOTRE cours : comprendre savoir réaliser et exploiter un alignement
Positionner les espèces dans un arbre taxonomique de référence.
Les élèves choisissent chacun une protéine, dans une liste que vous leur proposez (p. ex. insuline, EPO, amylase, cytochrome C, etc cf la liste proposée dans le cours http://doiop.com/listeprot ) et plusieurs espèces (de plusieurs embranchements, règnes si possible) et ils les alignent.
Leur faire regarder quels sont les a.a. dans les zones sombres et claires. Les aider à voir que les régions les plus foncées sont les régions qui sont les plus semblables pour toutes les espèces étudiées.
Repérer des zones de similitude voire d'identité à travers les espèces et des zones de différences.
Observer le degré de similitude (ou le nombre de différences) pour la même protéine :repérer les espèces pour lesquelles la protéine est la plus similaire et la plus différente.
Comparer différentes protéines : les espèces les plus similaires et les plus différentes sont-elles les mêmes , du même groupe ?
Discuter de la signification évolutive des similitudes (Origine commune ? Convergence ? ).
Discuter de la signification évolutive des différences : semblent-elles cohérentes ou aléatoires ? (Un dessein est-il discernable ?)
Plus avancé
Leur faire regarder quels sont les a.a. dans les zones sombres et claires.
Explorer la signification des zones conservées ? (visualiser les domaines importants (cf Scénario 5avancé))
En suivant le scénario 5 faire faire à
un groupe d'élèves prépare l'alignement d'une même protéine (ins) chez différentes espèces que nous savons similaires (mammifères)
un autre groupe d'élèves étudie la même protéine chez différentes espèces appartenant à un autre groupe d'espèces que nous savons similaires (oiseaux, etc),
comparer entre les groupes, observer si le degré de similitudes et de différences corrobore la classification basée sur l'anatomie.
Discuter de ce parallélisme.
Les documents sont tous sur
http://www.doiop.com/bist